ONKI3 | Medical Subject Headings

1. Ontologian/sanaston valinta

ONKI-selaimen avulla voit tutustua helposti eri ontologioihin ja sanastoihin. Voit valita käyttöösi jonkin näistä integroimalla sovelluksesi ONKI-palveluun tai vaihtoehtoisesti voit ladata ontologian/sanaston sisällön ONKI-selaimen kautta ja käyttää sitä sovelluksessasi ontologian/sanaston käyttöehtojen sallimalla tavalla.

Voit myös luoda oman ontologiasi/sanastosi ja ladata sen ONKI-palveluun. Ladattavan ontologian/sanaston voit luoda tyhjästä tai muokkaamalla jotain ONKIsta löytyvää ontologiaa/sanastoa. ONKIiin ladattavan ontologian/sanaston formaattina voit käyttää joko SKOS- tai OWL-formaattia. Sanastojen ja luokitusten esitystavaksi ONKI-palvelun ylläpitäjä suosittaa SKOS-formaattia, kun taas rikkaammat ontologiat lienee mielekkäintä esittää OWL-kielen avulla. Ontologia/sanasto-tiedoston voit tuoda ONKI-palveluun lataus-lomakkeen kautta. Lomakkeen täytettyäsi ontologiasi/sanastosi julkaistaan ONKI-palvelussa noin muutaman arkipäivän sisällä.

2. ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja sisällönkuvailussa

ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja/tai sisällönkuvailussa on ilmaista mutta se vaatii rekisteröitymisen. Rekisteröinnissä pyydettäviä tietoja käytetään yleiskuvan saamiseen siitä, mitä ja miten paljon palveluita käytetään ja kenen toimesta. Voimme myös hyödyntää sähköpostiosoitteita vakituisten käyttäjien informoimiseksi tärkeistä muutoksista palveluun liittyen.

ONKI-valitsin

Tekemälläsi tiedonhaku- ja sisällönkuvailu-lomakkeella ONKI-valitsinta voi hyödyntää älykkäänä tekstilaatikko-kenttänä. Käyttäjän kirjoittaessa kenttään tekstiä ONKI-valitsin tarjoaa valmiita vaihtoehtoja kentän alapuolelle. Vaihtoehtojen rajaus perustuu valittavien käsitteiden kirjoitusasuun, jota voidaan ONKI-valitsimessa rajoittaa jokerimerkkien avulla. Vaihtoehdot haetaan ONKI-palvelussa julkaistusta ontologiasta/sanastosta tai näiden osasta riippuen valituista käyttöasetuksista, jotka määritellään ONKI-valitsimen käyttöönotto-lomakkeella.

Sisällönkuvailussa valinta kohdistetaan yhteen käsitteeseen (esim. museoesineen tyyppi: kirveet), mutta tiedonhaussa ONKI-valitsinta voidaan käyttää myös haun laajennukseen ontologian suhdetietoa hyväksikäyttäen. Esimerkiksi valittaessa työkalut-hakusana museoesineiden hakulomakkeella hakuehtoihin voidaan lisätä automaattisesti mm. seuraavat hakutermit: kirveet, sirkkelit, taltat, jne.

Koneelliset rajapinnat

Koneellisten rajapintojen (Web service ja HTTP) kautta voit hyödyntää ONKIa ONKI-valitsinta joustavammin. Joustavuudelle oli tarvetta mm. SeCossa kehityssä SAHA-metatietoeditorissa, jonka toteutuksessa päädyttiin hyödyntämään ONKIn web service -rajapintaa ONKI-valitsimen sijaan. Web service -rajapinnan kautta voit kysyä mm. käsitteiden yksilöintitunnuksia (URI) vastaavia nimiä eri kielillä. Rajapinnan käyttöön pääset tutustumaan testisivun kautta, johon on kuvattu tarkemmat ohjeet käytöstä.

ONKI on osa ONKI Living Lab -toimintaa - avoin, käyttäjälähtöinen tosielämän kehitysympäristö, jossa kokeillaan käytännössä semattisen verkon teknologioita todellisten käyttäjien kuten sinun kanssasi. Yli 10 000 ihmistä käyttää ONKIa kuukausittain.

Toivomme että pidät ONKI-palvelusta ja nautit sen käytöstä omiin tarkoituksiisi!

Jos törmäät ongelmiin tai sinulla on kehitysideoita, ota yhteyttä ONKI-ryhmään. Olemme myös erittäin kiinnostuneita sinun menestystarinoistasi ONKIn käytössä - jaa kokemuksiasi meille ja muille!

ONKI-ryhmä:

Jouni Tuominen, Living Lab -yhteyshenkilö, APIt, widgetit, ontologioiden julkaisu ym.
Eero Hyvönen, professori, tutkimusryhmän johtaja

Aiemmat jäsenet: Kim Viljanen, Rami Alatalo.

Lisää tietoa:

SeCon kotisivu
Viimeisimmät semanttiset uutiset löydät seuraamalla meitä Twitterissä ja fanittamalla meitä Facebookissa!

Miten voimme auttaa sinua?

esitelmiä ONKIsta: mikä se on? miten sitä käytetään?
tukea ontologioiden kehittämiseen ja julkaisuun
sähköpostikäyttötuki
yhteistyötä projekteissa
ja muuta, kysy!


Hierarkia:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Solut ∟ Solurakenteet ∟ Solunsisäinen tila ∟ Solulima ∟ Sytoplasmarakenteet ∟ Soluelimet ∟ Mitokondriot 14 vieruskäsitettä 3 alakäsitettä ∟ Lihaksen mitokondriot \| ∟ Maksan mitokondriot \| ∟ Submitokondriaaliset hiukkaset ∟ Bakteerikromatofoorit \| ∟ Golgin laite \| ∟ Holviribonukleoproteiinipartikkelit \| ∟ Plastidit \| ∟ Ribosomit \| ∟ Sarkomeerit \| ∟ Solulimakalvosto \| ∟ Sytoplasman vesikkelit \| ∟ Tuma \| ∟ Mikrosomit \| ∟ Solunsisäinen neste \| ∟ Solunsisäiset kalvot \| ∟ Soluton järjestelmä \| ∟ Synaptosomit Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Solut ∟ Solurakenteet ∟ Subsellulaariset fraktiot ∟ Mitokondriot 14 vieruskäsitettä 3 alakäsitettä ∟ Lihaksen mitokondriot \| ∟ Maksan mitokondriot \| ∟ Submitokondriaaliset hiukkaset ∟ Bakteerikromatofoorit \| ∟ Golgin laite \| ∟ Holviribonukleoproteiinipartikkelit \| ∟ Plastidit \| ∟ Ribosomit \| ∟ Sarkomeerit \| ∟ Solulimakalvosto \| ∟ Sytoplasman vesikkelit \| ∟ Tuma \| ∟ Mikrosomit \| ∟ Solunsisäinen neste \| ∟ Solunsisäiset kalvot \| ∟ Soluton järjestelmä \| ∟ Synaptosomit X
Laajemmat termit:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Solut ∟ Solurakenteet ∟ Solunsisäinen tila ∟ Solulima ∟ Sytoplasmarakenteet ∟ Soluelimet ∟ Mitokondriot Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Solut ∟ Solurakenteet ∟ Subsellulaariset fraktiot ∟ Mitokondriot Soluelimet > Sytoplasmarakenteet > Solulima > Solunsisäinen tila > Solurakenteet > Solut > Medical Subject Headings (MeSH) Subsellulaariset fraktiot > Solurakenteet > Solut > Medical Subject Headings (MeSH) X
Suppeammat termit:	Lihaksen mitokondriot \| Maksan mitokondriot \| Submitokondriaaliset hiukkaset X
Annotaatio:	A 11 qualif except /cytol; /genet permitted; coord with organ /metab (IM) but not also organ /ultrastruct for metab studies, coord with organ /ultrastruct (IM) for morphol studies: TN 126; mitochondria of vasc or smooth musc tissue goes under MITOCHONDRIA, MUSCLE & do not coord with MUSCLE, SMOOTH or MUSCLE, SMOOTH, VASCULAR unless particularly discussed & then probably only NIM X
historyNote*:	MITOCHONDRIAL CONTRACTION was heading 1969-96 (was see under MITOCHONDRIA 1975, was Prov 1969-74) X
Huomautus:	Semiautonomous, self-reproducing organelles that occur in the cytoplasm of all cells of most, but not all, eukaryotes. Each mitochondrion is surrounded by a double limiting membrane. The inner membrane is highly invaginated, and its projections are called cristae. Mitochondria are the sites of the reactions of oxidative phosphorylation, which result in the formation of ATP. They contain distinctive RIBOSOMES, transfer RNAs (RNA, TRANSFER); AMINO ACYL T RNA SYNTHETASES; and elongation and termination factors. Mitochondria depend upon genes within the nucleus of the cells in which they reside for many essential messenger RNAs (RNA, MESSENGER). Mitochondria are believed to have arisen from aerobic bacteria that established a symbiotic relationship with primitive protoeukaryotes. (King & Stansfield, A Dictionary of Genetics, 4th ed) X
publicMeSHNote*:	MITOCHONDRIAL CONTRACTION was heading 1975-96 (see under MITOCHONDRIA 1975) X
activeMeSHYear*:	2004 \| 2005 \| 2006 \| 2007X
dateCreated*:	1999-01-01X
dateRevised*:	2003-07-09X
recordAuthorizer*:	sjnX
recordMaintainer*:	nnsX
recordOriginator*:	NLMX
Tyyppi:	Käsite X
Vierustermit:	Bakteerikromatofoorit \| Golgin laite \| Holviribonukleoproteiinipartikkelit \| Plastidit \| Ribosomit \| Sarkomeerit \| Solulimakalvosto \| Sytoplasman vesikkelit \| Tuma \| Mikrosomit \| Solunsisäinen neste \| Solunsisäiset kalvot \| Soluton järjestelmä \| Synaptosomit X
URI:	X
Nimikkeet ja vastaavat käsitteet:	Sauvajyväset (fi, korvattu) Sauvajyvänen (fi, korvattu) Mitokondrio (fi, korvattu) Mitokondrier (sv) Mitochondria (en) Mitochondrion (en, korvattu) Mitochondrion (la-FI, korvattu) X
Jaa:	X