ONKI3 | Medical Subject Headings

1. Ontologian/sanaston valinta

ONKI-selaimen avulla voit tutustua helposti eri ontologioihin ja sanastoihin. Voit valita käyttöösi jonkin näistä integroimalla sovelluksesi ONKI-palveluun tai vaihtoehtoisesti voit ladata ontologian/sanaston sisällön ONKI-selaimen kautta ja käyttää sitä sovelluksessasi ontologian/sanaston käyttöehtojen sallimalla tavalla.

Voit myös luoda oman ontologiasi/sanastosi ja ladata sen ONKI-palveluun. Ladattavan ontologian/sanaston voit luoda tyhjästä tai muokkaamalla jotain ONKIsta löytyvää ontologiaa/sanastoa. ONKIiin ladattavan ontologian/sanaston formaattina voit käyttää joko SKOS- tai OWL-formaattia. Sanastojen ja luokitusten esitystavaksi ONKI-palvelun ylläpitäjä suosittaa SKOS-formaattia, kun taas rikkaammat ontologiat lienee mielekkäintä esittää OWL-kielen avulla. Ontologia/sanasto-tiedoston voit tuoda ONKI-palveluun lataus-lomakkeen kautta. Lomakkeen täytettyäsi ontologiasi/sanastosi julkaistaan ONKI-palvelussa noin muutaman arkipäivän sisällä.

2. ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja sisällönkuvailussa

ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja/tai sisällönkuvailussa on ilmaista mutta se vaatii rekisteröitymisen. Rekisteröinnissä pyydettäviä tietoja käytetään yleiskuvan saamiseen siitä, mitä ja miten paljon palveluita käytetään ja kenen toimesta. Voimme myös hyödyntää sähköpostiosoitteita vakituisten käyttäjien informoimiseksi tärkeistä muutoksista palveluun liittyen.

ONKI-valitsin

Tekemälläsi tiedonhaku- ja sisällönkuvailu-lomakkeella ONKI-valitsinta voi hyödyntää älykkäänä tekstilaatikko-kenttänä. Käyttäjän kirjoittaessa kenttään tekstiä ONKI-valitsin tarjoaa valmiita vaihtoehtoja kentän alapuolelle. Vaihtoehtojen rajaus perustuu valittavien käsitteiden kirjoitusasuun, jota voidaan ONKI-valitsimessa rajoittaa jokerimerkkien avulla. Vaihtoehdot haetaan ONKI-palvelussa julkaistusta ontologiasta/sanastosta tai näiden osasta riippuen valituista käyttöasetuksista, jotka määritellään ONKI-valitsimen käyttöönotto-lomakkeella.

Sisällönkuvailussa valinta kohdistetaan yhteen käsitteeseen (esim. museoesineen tyyppi: kirveet), mutta tiedonhaussa ONKI-valitsinta voidaan käyttää myös haun laajennukseen ontologian suhdetietoa hyväksikäyttäen. Esimerkiksi valittaessa työkalut-hakusana museoesineiden hakulomakkeella hakuehtoihin voidaan lisätä automaattisesti mm. seuraavat hakutermit: kirveet, sirkkelit, taltat, jne.

Koneelliset rajapinnat

Koneellisten rajapintojen (Web service ja HTTP) kautta voit hyödyntää ONKIa ONKI-valitsinta joustavammin. Joustavuudelle oli tarvetta mm. SeCossa kehityssä SAHA-metatietoeditorissa, jonka toteutuksessa päädyttiin hyödyntämään ONKIn web service -rajapintaa ONKI-valitsimen sijaan. Web service -rajapinnan kautta voit kysyä mm. käsitteiden yksilöintitunnuksia (URI) vastaavia nimiä eri kielillä. Rajapinnan käyttöön pääset tutustumaan testisivun kautta, johon on kuvattu tarkemmat ohjeet käytöstä.

ONKI on osa ONKI Living Lab -toimintaa - avoin, käyttäjälähtöinen tosielämän kehitysympäristö, jossa kokeillaan käytännössä semattisen verkon teknologioita todellisten käyttäjien kuten sinun kanssasi. Yli 10 000 ihmistä käyttää ONKIa kuukausittain.

Toivomme että pidät ONKI-palvelusta ja nautit sen käytöstä omiin tarkoituksiisi!

Jos törmäät ongelmiin tai sinulla on kehitysideoita, ota yhteyttä ONKI-ryhmään. Olemme myös erittäin kiinnostuneita sinun menestystarinoistasi ONKIn käytössä - jaa kokemuksiasi meille ja muille!

ONKI-ryhmä:

Jouni Tuominen, Living Lab -yhteyshenkilö, APIt, widgetit, ontologioiden julkaisu ym.
Eero Hyvönen, professori, tutkimusryhmän johtaja

Aiemmat jäsenet: Kim Viljanen, Rami Alatalo.

Lisää tietoa:

SeCon kotisivu
Viimeisimmät semanttiset uutiset löydät seuraamalla meitä Twitterissä ja fanittamalla meitä Facebookissa!

Miten voimme auttaa sinua?

esitelmiä ONKIsta: mikä se on? miten sitä käytetään?
tukea ontologioiden kehittämiseen ja julkaisuun
sähköpostikäyttötuki
yhteistyötä projekteissa
ja muuta, kysy!

suomeksi på svenska in English

Esitystapa käsitteiden/termien suhteille: allekkain vierekkäin

Näytä käsitteiden/termien suhteet: erikseen hierarkiassa

DNA:n sitojaproteiinit

Ladataan tuloksia...


Hierarkia:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Aminohapot, peptidit ja proteiinit ∟ Valkuaisaineet ∟ DNA:n sitojaproteiinit 98 vieruskäsitettä 60 alakäsitettä ∟ Adenoviruksen E2-proteiinit \| ∟ AraC:tä transkriptoiva tekijä \| ∟ Butyraattivastetekijä 1 \| ∟ COUP-transkriptiotekijät \| ∟ Egr-transkriptiotekijät \| ∟ Emäksiset helix-loop-helix-transkriptiotekijät \| ∟ Emäksiset leucine zipper -transkriptiotekijät \| ∟ Erytroidispesifiset DNA:ta sitovat tekijät \| ∟ Fis-proteiini \| ∟ GATA-transkriptiotekijät \| ∟ GBF \| ∟ HMGA-proteiinit \| ∟ HMGB-proteiinit \| ∟ Homeodomain-proteiinit \| ∟ I-kappa B -proteiinit \| ∟ Integraation isäntätekijät \| ∟ Interferonia säätelevät tekijät \| ∟ Interferonistimuloitu geenitekijä 3 \| ∟ Kasvainsalpaajaproteiini p53 \| ∟ Kruppel-tyyppiset transkriptiotekijät \| ∟ Leusiinille reagoiva säätelyproteiini \| ∟ Maksasolujen tumatekijät \| ∟ MAR-sitojaproteiinit \| ∟ Metyyli-CpG:tä sitova proteiini 2 \| ∟ MutS DNA Mismatch-Binding -proteiini \| ∟ MutS Homolog 2 -proteiini \| ∟ Myeloidi-lymfoidi leukemiaproteiini \| ∟ NF-kappa B \| ∟ NFI-transkriptiotekijät \| ∟ Onkogeeniproteiini p55(v-myc) \| ∟ ORC \| ∟ Pax -transkriptiotekijät \| ∟ POU-domeenitekijät \| ∟ Proto-onkogeeniproteiini c-bcl-6 \| ∟ Proto-onkogeeniproteiini c-ets \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-myb \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-myc \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-rel \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-sis \| ∟ Rad51-rekombinaasi \| ∟ Rad52 DNA:n korjaus- ja rekombinaatioproteiini \| ∟ RBP-Jkappa \| ∟ Replikaatioproteiini A \| ∟ Replikaatioproteiini C \| ∟ Retinoblastoomaproteiini \| ∟ Sentromeeriproteiini B \| ∟ Smad-proteiinit \| ∟ Sukupuolta määräävä Y-alueen proteiini \| ∟ T-Box-domeenin proteiinit \| ∟ TCF-transkriptiotekijät \| ∟ Telomeerin sitojaproteiinit \| ∟ TLR-9 \| ∟ Transkriptiotekijä AP-2 \| ∟ Tristetraproliini \| ∟ Tuman heterogeeninen ribonukleeoproteiini K \| ∟ Tuman respiratoriset tekijät \| ∟ Virusten säätelyproteiinit \| ∟ Winged helix -transkriptiotekijät \| ∟ Xeroderma pigmentosum -sairauden A-ryhmän proteiini \| ∟ Yleiset transkriptiotekijät ∟ Aivo-selkäydinnesteen proteiinit \| ∟ Albumiinit \| ∟ Alkueläinproteiinit \| ∟ Amyloidi \| ∟ Antifreeze-proteiinit \| ∟ Apoproteiinit \| ∟ Aprotiini \| ∟ Arkaaiset proteiinit \| ∟ Armadillo-domeeniproteiinit \| ∟ Bakteeriproteiinit \| ∟ D011506Q000096* \| ∟ D011506Q000097* \| ∟ D011506Q000134* \| ∟ D011506Q000172* \| ∟ D011506Q000652* \| ∟ Dyneiiini-ATPaasi \| ∟ Epididymaaliset sekretoriset proteiinit \| ∟ FANC-proteiinit \| ∟ Flavoproteiinit \| ∟ Fosfoproteiinit \| ∟ Fotosynteettisen reaktiokeskuksen proteiinikompleksit \| ∟ Globuliinit \| ∟ Glykoproteiinit \| ∟ GTP:n sitojaproteiinin säätelijät \| ∟ Hammaskiilteen proteiinit \| ∟ Hemiproteiinit \| ∟ Hermokudosproteiinit \| ∟ Hopeaproteiinit \| ∟ Hyönteisproteiinit \| ∟ Jodoproteiinit \| ∟ Kalaproteiinit \| ∟ Kalvoproteiinit \| ∟ Kasvainproteiinit \| ∟ Kasviproteiinit \| ∟ Kolipaasit \| ∟ Kuljettajaproteiinit \| ∟ Kystatiinit \| ∟ LDL-reseptoriin liittyvät proteiinit \| ∟ Lektiinit \| ∟ Leväproteiinit \| ∟ Lintuproteiinit \| ∟ Lipoproteiinit \| ∟ Litostatiini \| ∟ Loismatoproteiinit \| ∟ Luminisoivat proteiinit \| ∟ Lämpösokkiproteiinit \| ∟ Lääkereseptorit \| ∟ Matelijoiden proteiinit \| ∟ Metalloproteiinit \| ∟ Mikrobien fotoreseptorit \| ∟ Mitokondrioproteiinit \| ∟ Molekylaariset kaitsijaproteiinit \| ∟ Munaproteiinit \| ∟ Mutanttiproteiinit \| ∟ Nukleoproteiinit \| ∟ Oksidatiivista fosforylaatiota kytkevät tekijät \| ∟ Parakriiniset peptiditekijät \| ∟ Peptonit \| ∟ Polyproteiinit \| ∟ Prionit \| ∟ Proteiini-isoformit \| ∟ Proteiinien alayksiköt \| ∟ Proteiinien esiasteet \| ∟ Proteiinihydrolysaatit \| ∟ Proteolipidit \| ∟ Proteomi \| ∟ Raskaudenaikaiset proteiinit \| ∟ Raudansäätelyproteiinit \| ∟ Ravinnon proteiinit \| ∟ Ribosomaaliset proteiinit \| ∟ Sammakkoeläinproteiinit \| ∟ Sekretoriset proteinaaseja salpaavat proteiinit \| ∟ Seleeniä sitovat proteiinit \| ∟ Selenoproteiinit \| ∟ Serpiinit \| ∟ Siemennesteen proteiinit \| ∟ Sieniproteiinit \| ∟ Sikiöproteiinit \| ∟ Silkki \| ∟ Silmän proteiinit \| ∟ Skleroproteiinit \| ∟ Solukierron proteiinit \| ∟ Solulima- ja tumareseptorit \| ∟ Solun tukirangan proteiinit \| ∟ Solunsisäiset signaalipeptidit- ja -proteiinit \| ∟ Supistajaproteiinit \| ∟ Surfaktanttiin liittyvät proteiinit \| ∟ Syljen proteiinit \| ∟ TIMP \| ∟ Tioredoksiini \| ∟ Transkriptiotekijät \| ∟ Tumaproteiinit \| ∟ Tymosiini \| ∟ Ubikitiinit \| ∟ Veren proteiinit \| ∟ Virusproteiinit \| ∟ Välittömät-aikaiset proteiinit \| ∟ Yhdistelmäproteiinit X
Laajemmat termit:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Aminohapot, peptidit ja proteiinit ∟ Valkuaisaineet ∟ DNA:n sitojaproteiinit Valkuaisaineet > Aminohapot, peptidit ja proteiinit > Medical Subject Headings (MeSH) X
Suppeammat termit:	Adenoviruksen E2-proteiinit \| AraC:tä transkriptoiva tekijä \| Butyraattivastetekijä 1 \| COUP-transkriptiotekijät \| Egr-transkriptiotekijät \| Emäksiset helix-loop-helix-transkriptiotekijät \| Emäksiset leucine zipper -transkriptiotekijät \| Erytroidispesifiset DNA:ta sitovat tekijät \| Fis-proteiini \| GATA-transkriptiotekijät \| GBF \| HMGA-proteiinit \| HMGB-proteiinit \| Homeodomain-proteiinit \| I-kappa B -proteiinit \| Integraation isäntätekijät \| Interferonia säätelevät tekijät \| Interferonistimuloitu geenitekijä 3 \| Kasvainsalpaajaproteiini p53 \| Kruppel-tyyppiset transkriptiotekijät \| Leusiinille reagoiva säätelyproteiini \| Maksasolujen tumatekijät \| MAR-sitojaproteiinit \| Metyyli-CpG:tä sitova proteiini 2 \| MutS DNA Mismatch-Binding -proteiini \| MutS Homolog 2 -proteiini \| Myeloidi-lymfoidi leukemiaproteiini \| NF-kappa B \| NFI-transkriptiotekijät \| Onkogeeniproteiini p55(v-myc) \| ORC \| Pax -transkriptiotekijät \| POU-domeenitekijät \| Proto-onkogeeniproteiini c-bcl-6 \| Proto-onkogeeniproteiini c-ets \| Proto-onkogeeniproteiinit c-myb \| Proto-onkogeeniproteiinit c-myc \| Proto-onkogeeniproteiinit c-rel \| Proto-onkogeeniproteiinit c-sis \| Rad51-rekombinaasi \| Rad52 DNA:n korjaus- ja rekombinaatioproteiini \| RBP-Jkappa \| Replikaatioproteiini A \| Replikaatioproteiini C \| Retinoblastoomaproteiini \| Sentromeeriproteiini B \| Smad-proteiinit \| Sukupuolta määräävä Y-alueen proteiini \| T-Box-domeenin proteiinit \| TCF-transkriptiotekijät \| Telomeerin sitojaproteiinit \| TLR-9 \| Transkriptiotekijä AP-2 \| Tristetraproliini \| Tuman heterogeeninen ribonukleeoproteiini K \| Tuman respiratoriset tekijät \| Virusten säätelyproteiinit \| Winged helix -transkriptiotekijät \| Xeroderma pigmentosum -sairauden A-ryhmän proteiini \| Yleiset transkriptiotekijät X
historyNote*:	84; DNA HELIX DESTABILIZING PROTEINS was see DNA UNWINDING PROTEINS 1980-83 X
Huomautus:	Carrier Proteins (1978-1981) \| DNA Unwinding Proteins (1981-1983)X
Huomautus:	Proteins which bind to DNA. The family includes proteins which bind to both double- and single-stranded DNA and also includes specific DNA binding proteins in serum which can be used as markers for malignant diseases. X
onlineNote*:	use DNA UNWINDING PROTEINS to search DNA HELIX DESTABILIZING PROTEINS 1980-83 X
publicMeSHNote*:	84; DNA HELIX DESTABILIZING PROTEINS was see DNA UNWINDING PROTEINS 1980-83 X
activeMeSHYear*:	2006 \| 2007X
dateCreated*:	1983-03-17X
dateEstablished*:	1984-01-01X
dateRevised*:	2005-06-30X
recordAuthorizer*:	sjnX
recordMaintainer*:	SYSTEMX
recordOriginator*:	RLSX
Rinnakkaistermi:	DNA-monistus \| Heliksi-käännös-heliksi \| Heliksi-mutka-heliksi \| Leusiinivetoketjut \| Sinkkisormet X
Tyyppi:	Käsite X
Vierustermit:	Aivo-selkäydinnesteen proteiinit \| Albumiinit \| Alkueläinproteiinit \| Amyloidi \| Antifreeze-proteiinit \| Apoproteiinit \| Aprotiini \| Arkaaiset proteiinit \| Armadillo-domeeniproteiinit \| Bakteeriproteiinit \| D011506Q000096* \| D011506Q000097* \| D011506Q000134* \| D011506Q000172* \| D011506Q000652* \| Dyneiiini-ATPaasi \| Epididymaaliset sekretoriset proteiinit \| FANC-proteiinit \| Flavoproteiinit \| Fosfoproteiinit \| Fotosynteettisen reaktiokeskuksen proteiinikompleksit \| Globuliinit \| Glykoproteiinit \| GTP:n sitojaproteiinin säätelijät \| Hammaskiilteen proteiinit \| Hemiproteiinit \| Hermokudosproteiinit \| Hopeaproteiinit \| Hyönteisproteiinit \| Jodoproteiinit \| Kalaproteiinit \| Kalvoproteiinit \| Kasvainproteiinit \| Kasviproteiinit \| Kolipaasit \| Kuljettajaproteiinit \| Kystatiinit \| LDL-reseptoriin liittyvät proteiinit \| Lektiinit \| Leväproteiinit \| Lintuproteiinit \| Lipoproteiinit \| Litostatiini \| Loismatoproteiinit \| Luminisoivat proteiinit \| Lämpösokkiproteiinit \| Lääkereseptorit \| Matelijoiden proteiinit \| Metalloproteiinit \| Mikrobien fotoreseptorit \| Mitokondrioproteiinit \| Molekylaariset kaitsijaproteiinit \| Munaproteiinit \| Mutanttiproteiinit \| Nukleoproteiinit \| Oksidatiivista fosforylaatiota kytkevät tekijät \| Parakriiniset peptiditekijät \| Peptonit \| Polyproteiinit \| Prionit \| Proteiini-isoformit \| Proteiinien alayksiköt \| Proteiinien esiasteet \| Proteiinihydrolysaatit \| Proteolipidit \| Proteomi \| Raskaudenaikaiset proteiinit \| Raudansäätelyproteiinit \| Ravinnon proteiinit \| Ribosomaaliset proteiinit \| Sammakkoeläinproteiinit \| Sekretoriset proteinaaseja salpaavat proteiinit \| Seleeniä sitovat proteiinit \| Selenoproteiinit \| Serpiinit \| Siemennesteen proteiinit \| Sieniproteiinit \| Sikiöproteiinit \| Silkki \| Silmän proteiinit \| Skleroproteiinit \| Solukierron proteiinit \| Solulima- ja tumareseptorit \| Solun tukirangan proteiinit \| Solunsisäiset signaalipeptidit- ja -proteiinit \| Supistajaproteiinit \| Surfaktanttiin liittyvät proteiinit \| Syljen proteiinit \| TIMP \| Tioredoksiini \| Transkriptiotekijät \| Tumaproteiinit \| Tymosiini \| Ubikitiinit \| Veren proteiinit \| Virusproteiinit \| Välittömät-aikaiset proteiinit \| Yhdistelmäproteiinit X
URI:	X
Nimikkeet ja vastaavat käsitteet:	DNA:ta sitova proteiini (fi, korvattu) DNA:ta sitovat proteiinit (fi, korvattu) DNA:n sitojaproteiini (fi, korvattu) DNA-bindande proteiner (sv) DNA-Binding Proteins (en) SS DNA BP (en, korvattu) DNA Single-Stranded Binding Protein (en, korvattu) Single-Stranded DNA-Binding Protein (en, korvattu) DNA Binding Protein (en, korvattu) X
Jaa:	X