ONKI3 | Medical Subject Headings

1. Ontologian/sanaston valinta

ONKI-selaimen avulla voit tutustua helposti eri ontologioihin ja sanastoihin. Voit valita käyttöösi jonkin näistä integroimalla sovelluksesi ONKI-palveluun tai vaihtoehtoisesti voit ladata ontologian/sanaston sisällön ONKI-selaimen kautta ja käyttää sitä sovelluksessasi ontologian/sanaston käyttöehtojen sallimalla tavalla.

Voit myös luoda oman ontologiasi/sanastosi ja ladata sen ONKI-palveluun. Ladattavan ontologian/sanaston voit luoda tyhjästä tai muokkaamalla jotain ONKIsta löytyvää ontologiaa/sanastoa. ONKIiin ladattavan ontologian/sanaston formaattina voit käyttää joko SKOS- tai OWL-formaattia. Sanastojen ja luokitusten esitystavaksi ONKI-palvelun ylläpitäjä suosittaa SKOS-formaattia, kun taas rikkaammat ontologiat lienee mielekkäintä esittää OWL-kielen avulla. Ontologia/sanasto-tiedoston voit tuoda ONKI-palveluun lataus-lomakkeen kautta. Lomakkeen täytettyäsi ontologiasi/sanastosi julkaistaan ONKI-palvelussa noin muutaman arkipäivän sisällä.

2. ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja sisällönkuvailussa

ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja/tai sisällönkuvailussa on ilmaista mutta se vaatii rekisteröitymisen. Rekisteröinnissä pyydettäviä tietoja käytetään yleiskuvan saamiseen siitä, mitä ja miten paljon palveluita käytetään ja kenen toimesta. Voimme myös hyödyntää sähköpostiosoitteita vakituisten käyttäjien informoimiseksi tärkeistä muutoksista palveluun liittyen.

ONKI-valitsin

Tekemälläsi tiedonhaku- ja sisällönkuvailu-lomakkeella ONKI-valitsinta voi hyödyntää älykkäänä tekstilaatikko-kenttänä. Käyttäjän kirjoittaessa kenttään tekstiä ONKI-valitsin tarjoaa valmiita vaihtoehtoja kentän alapuolelle. Vaihtoehtojen rajaus perustuu valittavien käsitteiden kirjoitusasuun, jota voidaan ONKI-valitsimessa rajoittaa jokerimerkkien avulla. Vaihtoehdot haetaan ONKI-palvelussa julkaistusta ontologiasta/sanastosta tai näiden osasta riippuen valituista käyttöasetuksista, jotka määritellään ONKI-valitsimen käyttöönotto-lomakkeella.

Sisällönkuvailussa valinta kohdistetaan yhteen käsitteeseen (esim. museoesineen tyyppi: kirveet), mutta tiedonhaussa ONKI-valitsinta voidaan käyttää myös haun laajennukseen ontologian suhdetietoa hyväksikäyttäen. Esimerkiksi valittaessa työkalut-hakusana museoesineiden hakulomakkeella hakuehtoihin voidaan lisätä automaattisesti mm. seuraavat hakutermit: kirveet, sirkkelit, taltat, jne.

Koneelliset rajapinnat

Koneellisten rajapintojen (Web service ja HTTP) kautta voit hyödyntää ONKIa ONKI-valitsinta joustavammin. Joustavuudelle oli tarvetta mm. SeCossa kehityssä SAHA-metatietoeditorissa, jonka toteutuksessa päädyttiin hyödyntämään ONKIn web service -rajapintaa ONKI-valitsimen sijaan. Web service -rajapinnan kautta voit kysyä mm. käsitteiden yksilöintitunnuksia (URI) vastaavia nimiä eri kielillä. Rajapinnan käyttöön pääset tutustumaan testisivun kautta, johon on kuvattu tarkemmat ohjeet käytöstä.

ONKI on osa ONKI Living Lab -toimintaa - avoin, käyttäjälähtöinen tosielämän kehitysympäristö, jossa kokeillaan käytännössä semattisen verkon teknologioita todellisten käyttäjien kuten sinun kanssasi. Yli 10 000 ihmistä käyttää ONKIa kuukausittain.

Toivomme että pidät ONKI-palvelusta ja nautit sen käytöstä omiin tarkoituksiisi!

Jos törmäät ongelmiin tai sinulla on kehitysideoita, ota yhteyttä ONKI-ryhmään. Olemme myös erittäin kiinnostuneita sinun menestystarinoistasi ONKIn käytössä - jaa kokemuksiasi meille ja muille!

ONKI-ryhmä:

Jouni Tuominen, Living Lab -yhteyshenkilö, APIt, widgetit, ontologioiden julkaisu ym.
Eero Hyvönen, professori, tutkimusryhmän johtaja

Aiemmat jäsenet: Kim Viljanen, Rami Alatalo.

Lisää tietoa:

SeCon kotisivu
Viimeisimmät semanttiset uutiset löydät seuraamalla meitä Twitterissä ja fanittamalla meitä Facebookissa!

Miten voimme auttaa sinua?

esitelmiä ONKIsta: mikä se on? miten sitä käytetään?
tukea ontologioiden kehittämiseen ja julkaisuun
sähköpostikäyttötuki
yhteistyötä projekteissa
ja muuta, kysy!


Hierarkia:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Aminohapot, peptidit ja proteiinit ∟ Valkuaisaineet ∟ Bakteeriproteiinit ∟ Fis-proteiini 82 vieruskäsitettä ∟ Adenoviruksen E2-proteiinit \| ∟ AraC:tä transkriptoiva tekijä \| ∟ Butyraattivastetekijä 1 \| ∟ COUP-transkriptiotekijät \| ∟ Egr-transkriptiotekijät \| ∟ Emäksiset helix-loop-helix-transkriptiotekijät \| ∟ Emäksiset leucine zipper -transkriptiotekijät \| ∟ Erytroidispesifiset DNA:ta sitovat tekijät \| ∟ GATA-transkriptiotekijät \| ∟ GBF \| ∟ HMGA-proteiinit \| ∟ HMGB-proteiinit \| ∟ Homeodomain-proteiinit \| ∟ I-kappa B -proteiinit \| ∟ Integraation isäntätekijät \| ∟ Interferonia säätelevät tekijät \| ∟ Interferonistimuloitu geenitekijä 3 \| ∟ Kasvainsalpaajaproteiini p53 \| ∟ Kruppel-tyyppiset transkriptiotekijät \| ∟ Leusiinille reagoiva säätelyproteiini \| ∟ Maksasolujen tumatekijät \| ∟ MAR-sitojaproteiinit \| ∟ Metyyli-CpG:tä sitova proteiini 2 \| ∟ MutS DNA Mismatch-Binding -proteiini \| ∟ MutS Homolog 2 -proteiini \| ∟ Myeloidi-lymfoidi leukemiaproteiini \| ∟ NF-kappa B \| ∟ NFI-transkriptiotekijät \| ∟ Onkogeeniproteiini p55(v-myc) \| ∟ ORC \| ∟ Pax -transkriptiotekijät \| ∟ POU-domeenitekijät \| ∟ Proto-onkogeeniproteiini c-bcl-6 \| ∟ Proto-onkogeeniproteiini c-ets \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-myb \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-myc \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-rel \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-sis \| ∟ Rad51-rekombinaasi \| ∟ Rad52 DNA:n korjaus- ja rekombinaatioproteiini \| ∟ RBP-Jkappa \| ∟ Replikaatioproteiini A \| ∟ Replikaatioproteiini C \| ∟ Retinoblastoomaproteiini \| ∟ Sentromeeriproteiini B \| ∟ Smad-proteiinit \| ∟ Sukupuolta määräävä Y-alueen proteiini \| ∟ T-Box-domeenin proteiinit \| ∟ TCF-transkriptiotekijät \| ∟ Telomeerin sitojaproteiinit \| ∟ TLR-9 \| ∟ Transkriptiotekijä AP-2 \| ∟ Tristetraproliini \| ∟ Tuman heterogeeninen ribonukleeoproteiini K \| ∟ Tuman respiratoriset tekijät \| ∟ Virusten säätelyproteiinit \| ∟ Winged helix -transkriptiotekijät \| ∟ Xeroderma pigmentosum -sairauden A-ryhmän proteiini \| ∟ Yleiset transkriptiotekijät \| ∟ Atsuriini \| ∟ Bakteerien lusiferaasit \| ∟ Bakteerien transferriinireseptorikompleksi \| ∟ Bakteerikapselit \| ∟ Bakteerin ulkomembraanin proteiinit \| ∟ Bakteriosiinit \| ∟ Botuliinit \| ∟ Ekfoliatiinit \| ∟ Escherichia coli -proteiinit \| ∟ Ferredoksiinit \| ∟ Flafodoksiini \| ∟ Flagelliini \| ∟ GroEL-proteiini \| ∟ GroES-proteiini \| ∟ Jäykkäkouristustoksiini \| ∟ Koagulaasi \| ∟ Kolisiinit \| ∟ Penisilliiniä sitovat proteiinit \| ∟ Periplasmiset proteiinit \| ∟ RNA-polymeraasi Sigma 54 \| ∟ Soluseinämän tukiranka \| ∟ Stafylokokkiproteiini A \| ∟ Streptavidiini Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Aminohapot, peptidit ja proteiinit ∟ Valkuaisaineet ∟ DNA:n sitojaproteiinit ∟ Fis-proteiini 82 vieruskäsitettä ∟ Adenoviruksen E2-proteiinit \| ∟ AraC:tä transkriptoiva tekijä \| ∟ Butyraattivastetekijä 1 \| ∟ COUP-transkriptiotekijät \| ∟ Egr-transkriptiotekijät \| ∟ Emäksiset helix-loop-helix-transkriptiotekijät \| ∟ Emäksiset leucine zipper -transkriptiotekijät \| ∟ Erytroidispesifiset DNA:ta sitovat tekijät \| ∟ GATA-transkriptiotekijät \| ∟ GBF \| ∟ HMGA-proteiinit \| ∟ HMGB-proteiinit \| ∟ Homeodomain-proteiinit \| ∟ I-kappa B -proteiinit \| ∟ Integraation isäntätekijät \| ∟ Interferonia säätelevät tekijät \| ∟ Interferonistimuloitu geenitekijä 3 \| ∟ Kasvainsalpaajaproteiini p53 \| ∟ Kruppel-tyyppiset transkriptiotekijät \| ∟ Leusiinille reagoiva säätelyproteiini \| ∟ Maksasolujen tumatekijät \| ∟ MAR-sitojaproteiinit \| ∟ Metyyli-CpG:tä sitova proteiini 2 \| ∟ MutS DNA Mismatch-Binding -proteiini \| ∟ MutS Homolog 2 -proteiini \| ∟ Myeloidi-lymfoidi leukemiaproteiini \| ∟ NF-kappa B \| ∟ NFI-transkriptiotekijät \| ∟ Onkogeeniproteiini p55(v-myc) \| ∟ ORC \| ∟ Pax -transkriptiotekijät \| ∟ POU-domeenitekijät \| ∟ Proto-onkogeeniproteiini c-bcl-6 \| ∟ Proto-onkogeeniproteiini c-ets \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-myb \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-myc \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-rel \| ∟ Proto-onkogeeniproteiinit c-sis \| ∟ Rad51-rekombinaasi \| ∟ Rad52 DNA:n korjaus- ja rekombinaatioproteiini \| ∟ RBP-Jkappa \| ∟ Replikaatioproteiini A \| ∟ Replikaatioproteiini C \| ∟ Retinoblastoomaproteiini \| ∟ Sentromeeriproteiini B \| ∟ Smad-proteiinit \| ∟ Sukupuolta määräävä Y-alueen proteiini \| ∟ T-Box-domeenin proteiinit \| ∟ TCF-transkriptiotekijät \| ∟ Telomeerin sitojaproteiinit \| ∟ TLR-9 \| ∟ Transkriptiotekijä AP-2 \| ∟ Tristetraproliini \| ∟ Tuman heterogeeninen ribonukleeoproteiini K \| ∟ Tuman respiratoriset tekijät \| ∟ Virusten säätelyproteiinit \| ∟ Winged helix -transkriptiotekijät \| ∟ Xeroderma pigmentosum -sairauden A-ryhmän proteiini \| ∟ Yleiset transkriptiotekijät \| ∟ Atsuriini \| ∟ Bakteerien lusiferaasit \| ∟ Bakteerien transferriinireseptorikompleksi \| ∟ Bakteerikapselit \| ∟ Bakteerin ulkomembraanin proteiinit \| ∟ Bakteriosiinit \| ∟ Botuliinit \| ∟ Ekfoliatiinit \| ∟ Escherichia coli -proteiinit \| ∟ Ferredoksiinit \| ∟ Flafodoksiini \| ∟ Flagelliini \| ∟ GroEL-proteiini \| ∟ GroES-proteiini \| ∟ Jäykkäkouristustoksiini \| ∟ Koagulaasi \| ∟ Kolisiinit \| ∟ Penisilliiniä sitovat proteiinit \| ∟ Periplasmiset proteiinit \| ∟ RNA-polymeraasi Sigma 54 \| ∟ Soluseinämän tukiranka \| ∟ Stafylokokkiproteiini A \| ∟ Streptavidiini X
Laajemmat termit:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Aminohapot, peptidit ja proteiinit ∟ Valkuaisaineet ∟ Bakteeriproteiinit ∟ Fis-proteiini Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Aminohapot, peptidit ja proteiinit ∟ Valkuaisaineet ∟ DNA:n sitojaproteiinit ∟ Fis-proteiini Bakteeriproteiinit > Valkuaisaineet > Aminohapot, peptidit ja proteiinit > Medical Subject Headings (MeSH) DNA:n sitojaproteiinit > Valkuaisaineet > Aminohapot, peptidit ja proteiinit > Medical Subject Headings (MeSH) X
historyNote*:	2003; for INVERSION STIMULATION FACTOR use INTEGRATION HOST FACTOR (NM) 1994-2002 X
Huomautus:	Carrier Proteins (1994-2002)X
Huomautus:	A highly abundant DNA binding protein whose expression is strongly correlated with the growth phase of bacteria. The protein plays a role in regulating DNA topology and activation of RIBOSOMAL RNA transcription. It was originally identified as a factor required for inversion stimulation by the Hin recombinase of SALMONELLA and Gin site-specific recombinase of BACTERIOPHAGE MU. X
publicMeSHNote*:	2003; INVERSION STIMULATION FACTOR were indexed under CARRIER PROTEINS 1994-2002; X
activeMeSHYear*:	2005 \| 2006 \| 2007X
dateCreated*:	2002-07-03X
dateEstablished*:	2003-01-01X
dateRevised*:	2004-07-07X
recordAuthorizer*:	sjnX
recordMaintainer*:	jmpX
recordOriginator*:	jmpX
Tyyppi:	Käsite X
Vierustermit:	Adenoviruksen E2-proteiinit \| AraC:tä transkriptoiva tekijä \| Butyraattivastetekijä 1 \| COUP-transkriptiotekijät \| Egr-transkriptiotekijät \| Emäksiset helix-loop-helix-transkriptiotekijät \| Emäksiset leucine zipper -transkriptiotekijät \| Erytroidispesifiset DNA:ta sitovat tekijät \| GATA-transkriptiotekijät \| GBF \| HMGA-proteiinit \| HMGB-proteiinit \| Homeodomain-proteiinit \| I-kappa B -proteiinit \| Integraation isäntätekijät \| Interferonia säätelevät tekijät \| Interferonistimuloitu geenitekijä 3 \| Kasvainsalpaajaproteiini p53 \| Kruppel-tyyppiset transkriptiotekijät \| Leusiinille reagoiva säätelyproteiini \| Maksasolujen tumatekijät \| MAR-sitojaproteiinit \| Metyyli-CpG:tä sitova proteiini 2 \| MutS DNA Mismatch-Binding -proteiini \| MutS Homolog 2 -proteiini \| Myeloidi-lymfoidi leukemiaproteiini \| NF-kappa B \| NFI-transkriptiotekijät \| Onkogeeniproteiini p55(v-myc) \| ORC \| Pax -transkriptiotekijät \| POU-domeenitekijät \| Proto-onkogeeniproteiini c-bcl-6 \| Proto-onkogeeniproteiini c-ets \| Proto-onkogeeniproteiinit c-myb \| Proto-onkogeeniproteiinit c-myc \| Proto-onkogeeniproteiinit c-rel \| Proto-onkogeeniproteiinit c-sis \| Rad51-rekombinaasi \| Rad52 DNA:n korjaus- ja rekombinaatioproteiini \| RBP-Jkappa \| Replikaatioproteiini A \| Replikaatioproteiini C \| Retinoblastoomaproteiini \| Sentromeeriproteiini B \| Smad-proteiinit \| Sukupuolta määräävä Y-alueen proteiini \| T-Box-domeenin proteiinit \| TCF-transkriptiotekijät \| Telomeerin sitojaproteiinit \| TLR-9 \| Transkriptiotekijä AP-2 \| Tristetraproliini \| Tuman heterogeeninen ribonukleeoproteiini K \| Tuman respiratoriset tekijät \| Virusten säätelyproteiinit \| Winged helix -transkriptiotekijät \| Xeroderma pigmentosum -sairauden A-ryhmän proteiini \| Yleiset transkriptiotekijät \| Atsuriini \| Bakteerien lusiferaasit \| Bakteerien transferriinireseptorikompleksi \| Bakteerikapselit \| Bakteerin ulkomembraanin proteiinit \| Bakteriosiinit \| Botuliinit \| Ekfoliatiinit \| Escherichia coli -proteiinit \| Ferredoksiinit \| Flafodoksiini \| Flagelliini \| GroEL-proteiini \| GroES-proteiini \| Jäykkäkouristustoksiini \| Koagulaasi \| Kolisiinit \| Penisilliiniä sitovat proteiinit \| Periplasmiset proteiinit \| RNA-polymeraasi Sigma 54 \| Soluseinämän tukiranka \| Stafylokokkiproteiini A \| Streptavidiini X
URI:	X
Nimikkeet ja vastaavat käsitteet:	Inversiota stimuloiva tekijä (fi, korvattu) Faktor för inversionsstimulering (sv) Factor For Inversion Stimulation Protein (en) Inversion Stimulation Factor (en, korvattu) HIN Recombinational Enhancer Binding Protein (en, korvattu) X
Jaa:	X