ONKI3 | Medical Subject Headings

1. Ontologian/sanaston valinta

ONKI-selaimen avulla voit tutustua helposti eri ontologioihin ja sanastoihin. Voit valita käyttöösi jonkin näistä integroimalla sovelluksesi ONKI-palveluun tai vaihtoehtoisesti voit ladata ontologian/sanaston sisällön ONKI-selaimen kautta ja käyttää sitä sovelluksessasi ontologian/sanaston käyttöehtojen sallimalla tavalla.

Voit myös luoda oman ontologiasi/sanastosi ja ladata sen ONKI-palveluun. Ladattavan ontologian/sanaston voit luoda tyhjästä tai muokkaamalla jotain ONKIsta löytyvää ontologiaa/sanastoa. ONKIiin ladattavan ontologian/sanaston formaattina voit käyttää joko SKOS- tai OWL-formaattia. Sanastojen ja luokitusten esitystavaksi ONKI-palvelun ylläpitäjä suosittaa SKOS-formaattia, kun taas rikkaammat ontologiat lienee mielekkäintä esittää OWL-kielen avulla. Ontologia/sanasto-tiedoston voit tuoda ONKI-palveluun lataus-lomakkeen kautta. Lomakkeen täytettyäsi ontologiasi/sanastosi julkaistaan ONKI-palvelussa noin muutaman arkipäivän sisällä.

2. ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja sisällönkuvailussa

ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja/tai sisällönkuvailussa on ilmaista mutta se vaatii rekisteröitymisen. Rekisteröinnissä pyydettäviä tietoja käytetään yleiskuvan saamiseen siitä, mitä ja miten paljon palveluita käytetään ja kenen toimesta. Voimme myös hyödyntää sähköpostiosoitteita vakituisten käyttäjien informoimiseksi tärkeistä muutoksista palveluun liittyen.

ONKI-valitsin

Tekemälläsi tiedonhaku- ja sisällönkuvailu-lomakkeella ONKI-valitsinta voi hyödyntää älykkäänä tekstilaatikko-kenttänä. Käyttäjän kirjoittaessa kenttään tekstiä ONKI-valitsin tarjoaa valmiita vaihtoehtoja kentän alapuolelle. Vaihtoehtojen rajaus perustuu valittavien käsitteiden kirjoitusasuun, jota voidaan ONKI-valitsimessa rajoittaa jokerimerkkien avulla. Vaihtoehdot haetaan ONKI-palvelussa julkaistusta ontologiasta/sanastosta tai näiden osasta riippuen valituista käyttöasetuksista, jotka määritellään ONKI-valitsimen käyttöönotto-lomakkeella.

Sisällönkuvailussa valinta kohdistetaan yhteen käsitteeseen (esim. museoesineen tyyppi: kirveet), mutta tiedonhaussa ONKI-valitsinta voidaan käyttää myös haun laajennukseen ontologian suhdetietoa hyväksikäyttäen. Esimerkiksi valittaessa työkalut-hakusana museoesineiden hakulomakkeella hakuehtoihin voidaan lisätä automaattisesti mm. seuraavat hakutermit: kirveet, sirkkelit, taltat, jne.

Koneelliset rajapinnat

Koneellisten rajapintojen (Web service ja HTTP) kautta voit hyödyntää ONKIa ONKI-valitsinta joustavammin. Joustavuudelle oli tarvetta mm. SeCossa kehityssä SAHA-metatietoeditorissa, jonka toteutuksessa päädyttiin hyödyntämään ONKIn web service -rajapintaa ONKI-valitsimen sijaan. Web service -rajapinnan kautta voit kysyä mm. käsitteiden yksilöintitunnuksia (URI) vastaavia nimiä eri kielillä. Rajapinnan käyttöön pääset tutustumaan testisivun kautta, johon on kuvattu tarkemmat ohjeet käytöstä.

ONKI on osa ONKI Living Lab -toimintaa - avoin, käyttäjälähtöinen tosielämän kehitysympäristö, jossa kokeillaan käytännössä semattisen verkon teknologioita todellisten käyttäjien kuten sinun kanssasi. Yli 10 000 ihmistä käyttää ONKIa kuukausittain.

Toivomme että pidät ONKI-palvelusta ja nautit sen käytöstä omiin tarkoituksiisi!

Jos törmäät ongelmiin tai sinulla on kehitysideoita, ota yhteyttä ONKI-ryhmään. Olemme myös erittäin kiinnostuneita sinun menestystarinoistasi ONKIn käytössä - jaa kokemuksiasi meille ja muille!

ONKI-ryhmä:

Jouni Tuominen, Living Lab -yhteyshenkilö, APIt, widgetit, ontologioiden julkaisu ym.
Eero Hyvönen, professori, tutkimusryhmän johtaja

Aiemmat jäsenet: Kim Viljanen, Rami Alatalo.

Lisää tietoa:

SeCon kotisivu
Viimeisimmät semanttiset uutiset löydät seuraamalla meitä Twitterissä ja fanittamalla meitä Facebookissa!

Miten voimme auttaa sinua?

esitelmiä ONKIsta: mikä se on? miten sitä käytetään?
tukea ontologioiden kehittämiseen ja julkaisuun
sähköpostikäyttötuki
yhteistyötä projekteissa
ja muuta, kysy!

suomeksi på svenska in English

Esitystapa käsitteiden/termien suhteille: allekkain vierekkäin

Näytä käsitteiden/termien suhteet: erikseen hierarkiassa

Geenin monistuminen

Ladataan tuloksia...


Hierarkia:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Perinnölliset ilmiöt ∟ Geneettinen muuntelu ∟ Mutaatio ∟ Geenin monistuminen 35 vieruskäsitettä 1 alakäsite ∟ D005784Q000379* ∟ DNA:n toistuman laajeneminen \| ∟ Geenin duplikaatio \| ∟ Geneettinen nondisjunktio \| ∟ Geneettinen suppressio \| ∟ Immunoglobuliinin somaattinen hypermutaatio \| ∟ Insertionaalinen mutageneesi \| ∟ Kääntymä \| ∟ Sekvenssin deleetio \| ∟ Translokaatio \| ∟ Arkaainen geeniekspression säätely \| ∟ Bakteerien geeniekspression säätely \| ∟ Entsymologinen geeniekspression säätely \| ∟ Epistasia \| ∟ Geneettinen epigeneesi \| ∟ Kasvien geeni-ilmentymisen säätely \| ∟ Kehityksellinen geeni-ilmentymisen säätely \| ∟ Kromatiinin kokoaminen ja pilkkominen \| ∟ Neoplastinen geeniekspression säätely \| ∟ Posttranskriptionaalinen RNA-käsittely \| ∟ Ribosomaalinen vaiheístuminen \| ∟ Sieniten geeniekspression säätely \| ∟ Transaktivaatio \| ∟ Translationaalinen proteiinimodifikaatio \| ∟ Up-regulation \| ∟ Vaimennussäätely \| ∟ Virusten geeniekspression säätely \| ∟ Alleeliepätasapaino \| ∟ Emäsparin yhteensopimattomuus \| ∟ Ituradan mutaatio \| ∟ Kromosomipoikkeavuudet \| ∟ Missense-mutaatio \| ∟ Nonsense-kodoni \| ∟ Perimän epästabiilius \| ∟ Pistemutaatio \| ∟ Vaiheistusmutaatio Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Perinnölliset prosessit ∟ Ilmentymisen säätely ∟ Geenin monistuminen 35 vieruskäsitettä 1 alakäsite ∟ D005784Q000379* ∟ DNA:n toistuman laajeneminen \| ∟ Geenin duplikaatio \| ∟ Geneettinen nondisjunktio \| ∟ Geneettinen suppressio \| ∟ Immunoglobuliinin somaattinen hypermutaatio \| ∟ Insertionaalinen mutageneesi \| ∟ Kääntymä \| ∟ Sekvenssin deleetio \| ∟ Translokaatio \| ∟ Arkaainen geeniekspression säätely \| ∟ Bakteerien geeniekspression säätely \| ∟ Entsymologinen geeniekspression säätely \| ∟ Epistasia \| ∟ Geneettinen epigeneesi \| ∟ Kasvien geeni-ilmentymisen säätely \| ∟ Kehityksellinen geeni-ilmentymisen säätely \| ∟ Kromatiinin kokoaminen ja pilkkominen \| ∟ Neoplastinen geeniekspression säätely \| ∟ Posttranskriptionaalinen RNA-käsittely \| ∟ Ribosomaalinen vaiheístuminen \| ∟ Sieniten geeniekspression säätely \| ∟ Transaktivaatio \| ∟ Translationaalinen proteiinimodifikaatio \| ∟ Up-regulation \| ∟ Vaimennussäätely \| ∟ Virusten geeniekspression säätely \| ∟ Alleeliepätasapaino \| ∟ Emäsparin yhteensopimattomuus \| ∟ Ituradan mutaatio \| ∟ Kromosomipoikkeavuudet \| ∟ Missense-mutaatio \| ∟ Nonsense-kodoni \| ∟ Perimän epästabiilius \| ∟ Pistemutaatio \| ∟ Vaiheistusmutaatio Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Perinnölliset prosessit ∟ Mutageneesi ∟ Geenin monistuminen 35 vieruskäsitettä 1 alakäsite ∟ D005784Q000379* ∟ DNA:n toistuman laajeneminen \| ∟ Geenin duplikaatio \| ∟ Geneettinen nondisjunktio \| ∟ Geneettinen suppressio \| ∟ Immunoglobuliinin somaattinen hypermutaatio \| ∟ Insertionaalinen mutageneesi \| ∟ Kääntymä \| ∟ Sekvenssin deleetio \| ∟ Translokaatio \| ∟ Arkaainen geeniekspression säätely \| ∟ Bakteerien geeniekspression säätely \| ∟ Entsymologinen geeniekspression säätely \| ∟ Epistasia \| ∟ Geneettinen epigeneesi \| ∟ Kasvien geeni-ilmentymisen säätely \| ∟ Kehityksellinen geeni-ilmentymisen säätely \| ∟ Kromatiinin kokoaminen ja pilkkominen \| ∟ Neoplastinen geeniekspression säätely \| ∟ Posttranskriptionaalinen RNA-käsittely \| ∟ Ribosomaalinen vaiheístuminen \| ∟ Sieniten geeniekspression säätely \| ∟ Transaktivaatio \| ∟ Translationaalinen proteiinimodifikaatio \| ∟ Up-regulation \| ∟ Vaimennussäätely \| ∟ Virusten geeniekspression säätely \| ∟ Alleeliepätasapaino \| ∟ Emäsparin yhteensopimattomuus \| ∟ Ituradan mutaatio \| ∟ Kromosomipoikkeavuudet \| ∟ Missense-mutaatio \| ∟ Nonsense-kodoni \| ∟ Perimän epästabiilius \| ∟ Pistemutaatio \| ∟ Vaiheistusmutaatio X
Laajemmat termit:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Perinnölliset ilmiöt ∟ Geneettinen muuntelu ∟ Mutaatio ∟ Geenin monistuminen Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Perinnölliset prosessit ∟ Ilmentymisen säätely ∟ Geenin monistuminen Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Perinnölliset prosessit ∟ Mutageneesi ∟ Geenin monistuminen Mutaatio > Geneettinen muuntelu > Perinnölliset ilmiöt > Medical Subject Headings (MeSH) Ilmentymisen säätely > Perinnölliset prosessit > Medical Subject Headings (MeSH) Mutageneesi > Perinnölliset prosessit > Medical Subject Headings (MeSH) X
Suppeammat termit:	D005784Q000379* X
Annotaatio:	for physiol process only; for technique use NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES or specifics X
historyNote*:	80 X
Huomautus:	Genes (1966-1967) \| Genes, Structural (1968-1979) \| Nucleic Acid Hybridization (1971-1979) \| Plasmids (1975-1979)X
Huomautus:	A selective increase in the number of copies of a gene coding for a specific protein without a proportional increase in other genes. It occurs naturally via the excision of a copy of the repeating sequence from the chromosome and its extrachromosomal replication in a plasmid, or via the production of an RNA transcript of the entire repeating sequence of ribosomal RNA followed by the reverse transcription of the molecule to produce an additional copy of the original DNA sequence. Laboratory techniques have been introduced for inducing disproportional replication by unequal crossing over, uptake of DNA from lysed cells, or generation of extrachromosomal sequences from rolling circle replication. X
publicMeSHNote*:	80 X
activeMeSHYear*:	2003 \| 2004 \| 2005 \| 2006 \| 2007X
dateCreated*:	1979-04-17X
dateEstablished*:	1980-01-01X
dateRevised*:	2002-07-02X
recordAuthorizer*:	sjnX
recordMaintainer*:	NDWX
recordOriginator*:	AEPX
Rinnakkaistermi:	Geenikopioiden määrä X
Tyyppi:	Käsite X
Vierustermit:	DNA:n toistuman laajeneminen \| Geenin duplikaatio \| Geneettinen nondisjunktio \| Geneettinen suppressio \| Immunoglobuliinin somaattinen hypermutaatio \| Insertionaalinen mutageneesi \| Kääntymä \| Sekvenssin deleetio \| Translokaatio \| Arkaainen geeniekspression säätely \| Bakteerien geeniekspression säätely \| Entsymologinen geeniekspression säätely \| Epistasia \| Geneettinen epigeneesi \| Kasvien geeni-ilmentymisen säätely \| Kehityksellinen geeni-ilmentymisen säätely \| Kromatiinin kokoaminen ja pilkkominen \| Neoplastinen geeniekspression säätely \| Posttranskriptionaalinen RNA-käsittely \| Ribosomaalinen vaiheístuminen \| Sieniten geeniekspression säätely \| Transaktivaatio \| Translationaalinen proteiinimodifikaatio \| Up-regulation \| Vaimennussäätely \| Virusten geeniekspression säätely \| Alleeliepätasapaino \| Emäsparin yhteensopimattomuus \| Ituradan mutaatio \| Kromosomipoikkeavuudet \| Missense-mutaatio \| Nonsense-kodoni \| Perimän epästabiilius \| Pistemutaatio \| Vaiheistusmutaatio X
URI:	X
Nimikkeet ja vastaavat käsitteet:	Geenin monistaminen (fi, korvattu) Genamplifiering (sv) Gene Amplification (en) X
Jaa:	X