ONKI3 | Medical Subject Headings

1. Ontologian/sanaston valinta

ONKI-selaimen avulla voit tutustua helposti eri ontologioihin ja sanastoihin. Voit valita käyttöösi jonkin näistä integroimalla sovelluksesi ONKI-palveluun tai vaihtoehtoisesti voit ladata ontologian/sanaston sisällön ONKI-selaimen kautta ja käyttää sitä sovelluksessasi ontologian/sanaston käyttöehtojen sallimalla tavalla.

Voit myös luoda oman ontologiasi/sanastosi ja ladata sen ONKI-palveluun. Ladattavan ontologian/sanaston voit luoda tyhjästä tai muokkaamalla jotain ONKIsta löytyvää ontologiaa/sanastoa. ONKIiin ladattavan ontologian/sanaston formaattina voit käyttää joko SKOS- tai OWL-formaattia. Sanastojen ja luokitusten esitystavaksi ONKI-palvelun ylläpitäjä suosittaa SKOS-formaattia, kun taas rikkaammat ontologiat lienee mielekkäintä esittää OWL-kielen avulla. Ontologia/sanasto-tiedoston voit tuoda ONKI-palveluun lataus-lomakkeen kautta. Lomakkeen täytettyäsi ontologiasi/sanastosi julkaistaan ONKI-palvelussa noin muutaman arkipäivän sisällä.

2. ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja sisällönkuvailussa

ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja/tai sisällönkuvailussa on ilmaista mutta se vaatii rekisteröitymisen. Rekisteröinnissä pyydettäviä tietoja käytetään yleiskuvan saamiseen siitä, mitä ja miten paljon palveluita käytetään ja kenen toimesta. Voimme myös hyödyntää sähköpostiosoitteita vakituisten käyttäjien informoimiseksi tärkeistä muutoksista palveluun liittyen.

ONKI-valitsin

Tekemälläsi tiedonhaku- ja sisällönkuvailu-lomakkeella ONKI-valitsinta voi hyödyntää älykkäänä tekstilaatikko-kenttänä. Käyttäjän kirjoittaessa kenttään tekstiä ONKI-valitsin tarjoaa valmiita vaihtoehtoja kentän alapuolelle. Vaihtoehtojen rajaus perustuu valittavien käsitteiden kirjoitusasuun, jota voidaan ONKI-valitsimessa rajoittaa jokerimerkkien avulla. Vaihtoehdot haetaan ONKI-palvelussa julkaistusta ontologiasta/sanastosta tai näiden osasta riippuen valituista käyttöasetuksista, jotka määritellään ONKI-valitsimen käyttöönotto-lomakkeella.

Sisällönkuvailussa valinta kohdistetaan yhteen käsitteeseen (esim. museoesineen tyyppi: kirveet), mutta tiedonhaussa ONKI-valitsinta voidaan käyttää myös haun laajennukseen ontologian suhdetietoa hyväksikäyttäen. Esimerkiksi valittaessa työkalut-hakusana museoesineiden hakulomakkeella hakuehtoihin voidaan lisätä automaattisesti mm. seuraavat hakutermit: kirveet, sirkkelit, taltat, jne.

Koneelliset rajapinnat

Koneellisten rajapintojen (Web service ja HTTP) kautta voit hyödyntää ONKIa ONKI-valitsinta joustavammin. Joustavuudelle oli tarvetta mm. SeCossa kehityssä SAHA-metatietoeditorissa, jonka toteutuksessa päädyttiin hyödyntämään ONKIn web service -rajapintaa ONKI-valitsimen sijaan. Web service -rajapinnan kautta voit kysyä mm. käsitteiden yksilöintitunnuksia (URI) vastaavia nimiä eri kielillä. Rajapinnan käyttöön pääset tutustumaan testisivun kautta, johon on kuvattu tarkemmat ohjeet käytöstä.

ONKI on osa ONKI Living Lab -toimintaa - avoin, käyttäjälähtöinen tosielämän kehitysympäristö, jossa kokeillaan käytännössä semattisen verkon teknologioita todellisten käyttäjien kuten sinun kanssasi. Yli 10 000 ihmistä käyttää ONKIa kuukausittain.

Toivomme että pidät ONKI-palvelusta ja nautit sen käytöstä omiin tarkoituksiisi!

Jos törmäät ongelmiin tai sinulla on kehitysideoita, ota yhteyttä ONKI-ryhmään. Olemme myös erittäin kiinnostuneita sinun menestystarinoistasi ONKIn käytössä - jaa kokemuksiasi meille ja muille!

ONKI-ryhmä:

Jouni Tuominen, Living Lab -yhteyshenkilö, APIt, widgetit, ontologioiden julkaisu ym.
Eero Hyvönen, professori, tutkimusryhmän johtaja

Aiemmat jäsenet: Kim Viljanen, Rami Alatalo.

Lisää tietoa:

SeCon kotisivu
Viimeisimmät semanttiset uutiset löydät seuraamalla meitä Twitterissä ja fanittamalla meitä Facebookissa!

Miten voimme auttaa sinua?

esitelmiä ONKIsta: mikä se on? miten sitä käytetään?
tukea ontologioiden kehittämiseen ja julkaisuun
sähköpostikäyttötuki
yhteistyötä projekteissa
ja muuta, kysy!


Hierarkia:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Bakteerit 107 vieruskäsitettä 17 alakäsitettä ∟ Aerobiset bakteerit \| ∟ Anaerobiset bakteerit \| ∟ Bacteroidetes \| ∟ Biofilmit \| ∟ Chlorobi \| ∟ Chloroflexi \| ∟ D001419Q000502* \| ∟ Epätyypilliset bakteerimuodot \| ∟ Fusobakteerit \| ∟ Gramnegatiiviset bakteerit \| ∟ Grampositiiviset bakteerit \| ∟ Proteobakteerit \| ∟ Rikkiä pelkistävät bakteerit \| ∟ Sisäitiöitä muodostavat bakteerit \| ∟ Spirochaetales \| ∟ Syanobakteerit \| ∟ Veriteitse leviävät patogeenit ∟ Aistinelimet \| ∟ Alkion rakenneosat \| ∟ Aminohapot, peptidit ja proteiinit \| ∟ Anestesia ja analgesia \| ∟ Archaea \| ∟ Bakteeri-infektiot ja mykoosit \| ∟ Biokemialliset ilmiöt, aineenvaihdunta ja ravitsemus \| ∟ Biologiset ilmiöt, soluilmiöt ja immuniteetti \| ∟ Biologiset tekijät \| ∟ Biologiset tieteet \| ∟ Biolääketieteelliset ja hammashoitomateriaalit \| ∟ Diagnoosi \| ∟ Eläimet \| ∟ Eläinsairaudet \| ∟ Eläinten rakenteet \| ∟ Endokriiniset sairaudet \| ∟ Entsyymit ja koentsyymit \| ∟ Epäorgaaniset kemikaalit \| ∟ Fysiologiset prosessit \| ∟ Hammaslääketiede \| ∟ Hengityselimet \| ∟ Hengityselinten taudit \| ∟ Henkilöt \| ∟ Hermosto \| ∟ Hermoston sairaudet \| ∟ Heterosykliset yhdisteet \| ∟ Hiilihydraatit \| ∟ Hoitomenetelmät \| ∟ Hormonit, hormonikorvikkeet ja hormoniantagonistit \| ∟ Humanistiset tieteet \| ∟ Ihmisten toiminnot \| ∟ Iho ja ihon apuelimet \| ∟ Iho- ja sidekudossairaudet \| ∟ Immuunijärjestelmän sairaudet \| ∟ Informatiikka \| ∟ Julkaisuformaatit \| ∟ Julkaisun osat \| ∟ Kasvaimet \| ∟ Kasvit \| ∟ Kehonalueet \| ∟ Kemialliset ja farmakologiset ilmiöt \| ∟ Kemikaalien vaikutukset ja käyttötarkoitukset \| ∟ Koostumukseltaan vaihtelevat seokset \| ∟ Korva-, nenä- ja kurkkutaudit \| ∟ Koulutus \| ∟ Kudokset \| ∟ Käyttäytyminen ja käyttäytymismekanismit \| ∟ Käyttäytymistieteet ja -toiminnat \| ∟ Leikkaukset \| ∟ Levät \| ∟ Lipidit \| ∟ Lisääntymis- ja virtsaelinten fysiologia \| ∟ Loistaudit \| ∟ Luonnontieteet \| ∟ Lääkevalmisteet \| ∟ Makromolekulaariset aineet \| ∟ Mesomycetozoea \| ∟ Mielenterveyshäiriöt \| ∟ Miesten virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet \| ∟ Muskuloskeletaalinen, neuraalinen ja okulaarinen fysiologia \| ∟ Naisen virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet ja raskauskomplikaatiot \| ∟ Nesteet ja eritteet \| ∟ Nukleiinihapot, nukleotidit ja nukleosidit \| ∟ Orgaaniset kemikaalit \| ∟ Patologiset tilat, löydökset ja oireet \| ∟ Perinnölliset ilmiöt \| ∟ Perinnölliset prosessit \| ∟ Perinnöllisyyteen liittyvät rakenneosat \| ∟ Polysykliset yhdisteet \| ∟ Psykologiset ilmiöt ja prosessit \| ∟ Purentaelimistö \| ∟ Purentaelimistön sairaudet \| ∟ Ravitsemus- ja aineenvaihduntasairaudet \| ∟ Ruuansulatusjärjestelmä \| ∟ Ruuansulatusjärjestelmän sairaudet \| ∟ Ruuansulatusjärjestelmän, suun ja ihon fysiologia \| ∟ Ruuat ja juomat \| ∟ Sienet \| ∟ Silmätaudit \| ∟ Solut \| ∟ Sydän- ja verisuonitaudit \| ∟ Synnynnäiset, perinnölliset ja vastasyntyneen taudit ja epämuodostumat \| ∟ Tarvikkeet ja varusteet \| ∟ Teollisuuden ja maatalouden teknologia \| ∟ Terveydenhuollon ammatit \| ∟ Terveydenhuollon laatu, saatavuus ja arviointi \| ∟ Terveydenhuoltotoimitilat, -henkilöstö ja -palvelut \| ∟ Terveyspalvelujen hallinto \| ∟ Terveystaloustiede ja terveystaloustieteelliset järjestöt \| ∟ Tuki- ja liikuntaelimet \| ∟ Tuki- ja liikuntaelinten sairaudet \| ∟ Tutkimuksen ominaispiirteet \| ∟ Tutkimusmenetelmät \| ∟ Tutkimustuki \| ∟ Umpieritysjärjestelmä \| ∟ Verenkierto- ja hengitysfysiologia \| ∟ Verenkiertoelimet \| ∟ Veri- ja immuunijärjestelmät \| ∟ Veri- ja lymfaattiset taudit \| ∟ Virtsa- ja sukupuolielimet \| ∟ Virukset \| ∟ Virussairaudet \| ∟ Väestön ominaispiirteet \| ∟ Yhteiskuntatieteet \| ∟ Ympäristö ja kansanterveys \| ∟ Ympäristöperäiset sairaudet \| ∟ Z. Maantieteelliset nimet X
Laajemmat termit:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Bakteerit Medical Subject Headings (MeSH) X
Suppeammat termit:	Aerobiset bakteerit \| Anaerobiset bakteerit \| Bacteroidetes \| Biofilmit \| Chlorobi \| Chloroflexi \| D001419Q000502* \| Epätyypilliset bakteerimuodot \| Fusobakteerit \| Gramnegatiiviset bakteerit \| Grampositiiviset bakteerit \| Proteobakteerit \| Rikkiä pelkistävät bakteerit \| Sisäitiöitä muodostavat bakteerit \| Spirochaetales \| Syanobakteerit \| Veriteitse leviävät patogeenit X
Annotaatio:	general; prefer specifics; relation to bacterial disease: Manual 22.12-22.16; presence of bacteria in organs vs infection: Manual 22.11; note many precoordinated bacterial - terms (BACTERIAL PROTEINS; ANTIBODIES, BACTERIAL; etc); "coliform bacteria" = COLIFORM BACILLI see ENTEROBACTERIACEAE; presence of bacteria in blood = BACTEREMIA: see note there; DF: BACT X
historyNote*:	1963 X
Huomautus:	One of the three domains of life (the others being Eukarya and ARCHAEA), also called Eubacteria. They are unicellular prokaryotic microorganisms which generally possess rigid cell walls, multiply by cell division, and exhibit three principal forms: round or coccal, rodlike or bacillary, and spiral or spirochetal. Bacteria can be classified by their response to OXYGEN: aerobic, anaerobic, or facultatively anaerobic; by the mode by which they obtain their energy: chemotrophy (via chemical reaction) or PHOTOTROPHY (via light reaction); for chemotrophs by their source of chemical energy: CHEMOLITHOTROPHY (from inorganic compounds) or chemoorganotrophy (from organic compounds); and by their source for CARBON; NITROGEN; etc.; HETEROTROPHY (from organic sources) or AUTOTROPHY (from CARBON DIOXIDE). They can also be classified by whether or not they stain (based on the structure of their CELL WALLS) with CRYSTAL VIOLET dye: gram-negative or gram-positive. X
publicMeSHNote*:	1963 X
activeMeSHYear*:	2007X
dateCreated*:	1999-01-01X
dateRevised*:	2006-07-05X
recordAuthorizer*:	sjnX
recordMaintainer*:	nnsX
recordOriginator*:	NLMX
Rinnakkaistermi:	Bakteerifimbriat \| Sukupuoliulokkeet X
runningHead*:	B3 - ORGANISMS-BACTERIA X
Tyyppi:	Käsite X
Vierustermit:	Aistinelimet \| Alkion rakenneosat \| Aminohapot, peptidit ja proteiinit \| Anestesia ja analgesia \| Archaea \| Bakteeri-infektiot ja mykoosit \| Biokemialliset ilmiöt, aineenvaihdunta ja ravitsemus \| Biologiset ilmiöt, soluilmiöt ja immuniteetti \| Biologiset tekijät \| Biologiset tieteet \| Biolääketieteelliset ja hammashoitomateriaalit \| Diagnoosi \| Eläimet \| Eläinsairaudet \| Eläinten rakenteet \| Endokriiniset sairaudet \| Entsyymit ja koentsyymit \| Epäorgaaniset kemikaalit \| Fysiologiset prosessit \| Hammaslääketiede \| Hengityselimet \| Hengityselinten taudit \| Henkilöt \| Hermosto \| Hermoston sairaudet \| Heterosykliset yhdisteet \| Hiilihydraatit \| Hoitomenetelmät \| Hormonit, hormonikorvikkeet ja hormoniantagonistit \| Humanistiset tieteet \| Ihmisten toiminnot \| Iho ja ihon apuelimet \| Iho- ja sidekudossairaudet \| Immuunijärjestelmän sairaudet \| Informatiikka \| Julkaisuformaatit \| Julkaisun osat \| Kasvaimet \| Kasvit \| Kehonalueet \| Kemialliset ja farmakologiset ilmiöt \| Kemikaalien vaikutukset ja käyttötarkoitukset \| Koostumukseltaan vaihtelevat seokset \| Korva-, nenä- ja kurkkutaudit \| Koulutus \| Kudokset \| Käyttäytyminen ja käyttäytymismekanismit \| Käyttäytymistieteet ja -toiminnat \| Leikkaukset \| Levät \| Lipidit \| Lisääntymis- ja virtsaelinten fysiologia \| Loistaudit \| Luonnontieteet \| Lääkevalmisteet \| Makromolekulaariset aineet \| Mesomycetozoea \| Mielenterveyshäiriöt \| Miesten virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet \| Muskuloskeletaalinen, neuraalinen ja okulaarinen fysiologia \| Naisen virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet ja raskauskomplikaatiot \| Nesteet ja eritteet \| Nukleiinihapot, nukleotidit ja nukleosidit \| Orgaaniset kemikaalit \| Patologiset tilat, löydökset ja oireet \| Perinnölliset ilmiöt \| Perinnölliset prosessit \| Perinnöllisyyteen liittyvät rakenneosat \| Polysykliset yhdisteet \| Psykologiset ilmiöt ja prosessit \| Purentaelimistö \| Purentaelimistön sairaudet \| Ravitsemus- ja aineenvaihduntasairaudet \| Ruuansulatusjärjestelmä \| Ruuansulatusjärjestelmän sairaudet \| Ruuansulatusjärjestelmän, suun ja ihon fysiologia \| Ruuat ja juomat \| Sienet \| Silmätaudit \| Solut \| Sydän- ja verisuonitaudit \| Synnynnäiset, perinnölliset ja vastasyntyneen taudit ja epämuodostumat \| Tarvikkeet ja varusteet \| Teollisuuden ja maatalouden teknologia \| Terveydenhuollon ammatit \| Terveydenhuollon laatu, saatavuus ja arviointi \| Terveydenhuoltotoimitilat, -henkilöstö ja -palvelut \| Terveyspalvelujen hallinto \| Terveystaloustiede ja terveystaloustieteelliset järjestöt \| Tuki- ja liikuntaelimet \| Tuki- ja liikuntaelinten sairaudet \| Tutkimuksen ominaispiirteet \| Tutkimusmenetelmät \| Tutkimustuki \| Umpieritysjärjestelmä \| Verenkierto- ja hengitysfysiologia \| Verenkiertoelimet \| Veri- ja immuunijärjestelmät \| Veri- ja lymfaattiset taudit \| Virtsa- ja sukupuolielimet \| Virukset \| Virussairaudet \| Väestön ominaispiirteet \| Yhteiskuntatieteet \| Ympäristö ja kansanterveys \| Ympäristöperäiset sairaudet \| Z. Maantieteelliset nimet X
URI:	X
Nimikkeet ja vastaavat käsitteet:	Bakteeri (fi, korvattu) Bakterier (sv) Bacteria (en) Eubacteria (en, korvattu) Bacterium (la-FI, korvattu) X
Jaa:	X