ONKI3 | Medical Subject Headings

1. Ontologian/sanaston valinta

ONKI-selaimen avulla voit tutustua helposti eri ontologioihin ja sanastoihin. Voit valita käyttöösi jonkin näistä integroimalla sovelluksesi ONKI-palveluun tai vaihtoehtoisesti voit ladata ontologian/sanaston sisällön ONKI-selaimen kautta ja käyttää sitä sovelluksessasi ontologian/sanaston käyttöehtojen sallimalla tavalla.

Voit myös luoda oman ontologiasi/sanastosi ja ladata sen ONKI-palveluun. Ladattavan ontologian/sanaston voit luoda tyhjästä tai muokkaamalla jotain ONKIsta löytyvää ontologiaa/sanastoa. ONKIiin ladattavan ontologian/sanaston formaattina voit käyttää joko SKOS- tai OWL-formaattia. Sanastojen ja luokitusten esitystavaksi ONKI-palvelun ylläpitäjä suosittaa SKOS-formaattia, kun taas rikkaammat ontologiat lienee mielekkäintä esittää OWL-kielen avulla. Ontologia/sanasto-tiedoston voit tuoda ONKI-palveluun lataus-lomakkeen kautta. Lomakkeen täytettyäsi ontologiasi/sanastosi julkaistaan ONKI-palvelussa noin muutaman arkipäivän sisällä.

2. ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja sisällönkuvailussa

ONKI-palvelun käyttö tiedonhaussa ja/tai sisällönkuvailussa on ilmaista mutta se vaatii rekisteröitymisen. Rekisteröinnissä pyydettäviä tietoja käytetään yleiskuvan saamiseen siitä, mitä ja miten paljon palveluita käytetään ja kenen toimesta. Voimme myös hyödyntää sähköpostiosoitteita vakituisten käyttäjien informoimiseksi tärkeistä muutoksista palveluun liittyen.

ONKI-valitsin

Tekemälläsi tiedonhaku- ja sisällönkuvailu-lomakkeella ONKI-valitsinta voi hyödyntää älykkäänä tekstilaatikko-kenttänä. Käyttäjän kirjoittaessa kenttään tekstiä ONKI-valitsin tarjoaa valmiita vaihtoehtoja kentän alapuolelle. Vaihtoehtojen rajaus perustuu valittavien käsitteiden kirjoitusasuun, jota voidaan ONKI-valitsimessa rajoittaa jokerimerkkien avulla. Vaihtoehdot haetaan ONKI-palvelussa julkaistusta ontologiasta/sanastosta tai näiden osasta riippuen valituista käyttöasetuksista, jotka määritellään ONKI-valitsimen käyttöönotto-lomakkeella.

Sisällönkuvailussa valinta kohdistetaan yhteen käsitteeseen (esim. museoesineen tyyppi: kirveet), mutta tiedonhaussa ONKI-valitsinta voidaan käyttää myös haun laajennukseen ontologian suhdetietoa hyväksikäyttäen. Esimerkiksi valittaessa työkalut-hakusana museoesineiden hakulomakkeella hakuehtoihin voidaan lisätä automaattisesti mm. seuraavat hakutermit: kirveet, sirkkelit, taltat, jne.

Koneelliset rajapinnat

Koneellisten rajapintojen (Web service ja HTTP) kautta voit hyödyntää ONKIa ONKI-valitsinta joustavammin. Joustavuudelle oli tarvetta mm. SeCossa kehityssä SAHA-metatietoeditorissa, jonka toteutuksessa päädyttiin hyödyntämään ONKIn web service -rajapintaa ONKI-valitsimen sijaan. Web service -rajapinnan kautta voit kysyä mm. käsitteiden yksilöintitunnuksia (URI) vastaavia nimiä eri kielillä. Rajapinnan käyttöön pääset tutustumaan testisivun kautta, johon on kuvattu tarkemmat ohjeet käytöstä.

ONKI on osa ONKI Living Lab -toimintaa - avoin, käyttäjälähtöinen tosielämän kehitysympäristö, jossa kokeillaan käytännössä semattisen verkon teknologioita todellisten käyttäjien kuten sinun kanssasi. Yli 10 000 ihmistä käyttää ONKIa kuukausittain.

Toivomme että pidät ONKI-palvelusta ja nautit sen käytöstä omiin tarkoituksiisi!

Jos törmäät ongelmiin tai sinulla on kehitysideoita, ota yhteyttä ONKI-ryhmään. Olemme myös erittäin kiinnostuneita sinun menestystarinoistasi ONKIn käytössä - jaa kokemuksiasi meille ja muille!

ONKI-ryhmä:

Jouni Tuominen, Living Lab -yhteyshenkilö, APIt, widgetit, ontologioiden julkaisu ym.
Eero Hyvönen, professori, tutkimusryhmän johtaja

Aiemmat jäsenet: Kim Viljanen, Rami Alatalo.

Lisää tietoa:

SeCon kotisivu
Viimeisimmät semanttiset uutiset löydät seuraamalla meitä Twitterissä ja fanittamalla meitä Facebookissa!

Miten voimme auttaa sinua?

esitelmiä ONKIsta: mikä se on? miten sitä käytetään?
tukea ontologioiden kehittämiseen ja julkaisuun
sähköpostikäyttötuki
yhteistyötä projekteissa
ja muuta, kysy!


Hierarkia:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Virukset ∟ RNA-virukset ∟ Retrovirukset 32 vieruskäsitettä 9 alakäsitettä ∟ Alfaretrovirus \| ∟ Apinan retrovirukset \| ∟ Beetaretrovirus \| ∟ Deltaretrovirus \| ∟ Endogeeniset retrovirukset \| ∟ Epsilonretrovirus \| ∟ Gammaretrovirus \| ∟ Lentivirus \| ∟ Spumavirus ∟ Onkogeeniset DNA-virukset \| ∟ Aivotulehdusvirukset \| ∟ Arenavirukset \| ∟ Astroviridae \| ∟ Birnavirukset \| ∟ Bromoviridae \| ∟ Bunyavirukset \| ∟ Deltahepatiittivirus \| ∟ Flavivirukset \| ∟ Flexiviridae \| ∟ Hepevirus \| ∟ Kalikivirukset \| ∟ Klosterovirukset \| ∟ Komovirukset \| ∟ Kystovirukset \| ∟ Levivirukset \| ∟ Luteoviridae \| ∟ Mononegavirales \| ∟ Mosaiikkivirukset \| ∟ Myksovirukset \| ∟ Nidovirales \| ∟ Nodavirukset \| ∟ Pikobirnavirus \| ∟ Pikornavirukset \| ∟ Potyviridae \| ∟ Reovirukset \| ∟ Sequiviridae \| ∟ Tenuivirus \| ∟ Togavirukset \| ∟ Tombusvirukset \| ∟ Totivirukset \| ∟ Tymoviridae Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Virukset ∟ Selkärankaisten virukset ∟ Kasvainvirukset ∟ Retrovirukset 32 vieruskäsitettä 9 alakäsitettä ∟ Alfaretrovirus \| ∟ Apinan retrovirukset \| ∟ Beetaretrovirus \| ∟ Deltaretrovirus \| ∟ Endogeeniset retrovirukset \| ∟ Epsilonretrovirus \| ∟ Gammaretrovirus \| ∟ Lentivirus \| ∟ Spumavirus ∟ Onkogeeniset DNA-virukset \| ∟ Aivotulehdusvirukset \| ∟ Arenavirukset \| ∟ Astroviridae \| ∟ Birnavirukset \| ∟ Bromoviridae \| ∟ Bunyavirukset \| ∟ Deltahepatiittivirus \| ∟ Flavivirukset \| ∟ Flexiviridae \| ∟ Hepevirus \| ∟ Kalikivirukset \| ∟ Klosterovirukset \| ∟ Komovirukset \| ∟ Kystovirukset \| ∟ Levivirukset \| ∟ Luteoviridae \| ∟ Mononegavirales \| ∟ Mosaiikkivirukset \| ∟ Myksovirukset \| ∟ Nidovirales \| ∟ Nodavirukset \| ∟ Pikobirnavirus \| ∟ Pikornavirukset \| ∟ Potyviridae \| ∟ Reovirukset \| ∟ Sequiviridae \| ∟ Tenuivirus \| ∟ Togavirukset \| ∟ Tombusvirukset \| ∟ Totivirukset \| ∟ Tymoviridae Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Virukset ∟ Selkärankaisten virukset ∟ RNA-virukset ∟ Retrovirukset 32 vieruskäsitettä 9 alakäsitettä ∟ Alfaretrovirus \| ∟ Apinan retrovirukset \| ∟ Beetaretrovirus \| ∟ Deltaretrovirus \| ∟ Endogeeniset retrovirukset \| ∟ Epsilonretrovirus \| ∟ Gammaretrovirus \| ∟ Lentivirus \| ∟ Spumavirus ∟ Onkogeeniset DNA-virukset \| ∟ Aivotulehdusvirukset \| ∟ Arenavirukset \| ∟ Astroviridae \| ∟ Birnavirukset \| ∟ Bromoviridae \| ∟ Bunyavirukset \| ∟ Deltahepatiittivirus \| ∟ Flavivirukset \| ∟ Flexiviridae \| ∟ Hepevirus \| ∟ Kalikivirukset \| ∟ Klosterovirukset \| ∟ Komovirukset \| ∟ Kystovirukset \| ∟ Levivirukset \| ∟ Luteoviridae \| ∟ Mononegavirales \| ∟ Mosaiikkivirukset \| ∟ Myksovirukset \| ∟ Nidovirales \| ∟ Nodavirukset \| ∟ Pikobirnavirus \| ∟ Pikornavirukset \| ∟ Potyviridae \| ∟ Reovirukset \| ∟ Sequiviridae \| ∟ Tenuivirus \| ∟ Togavirukset \| ∟ Tombusvirukset \| ∟ Totivirukset \| ∟ Tymoviridae X
Laajemmat termit:	Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Virukset ∟ RNA-virukset ∟ Retrovirukset Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Virukset ∟ Selkärankaisten virukset ∟ Kasvainvirukset ∟ Retrovirukset Medical Subject Headings (MeSH) ∟ Virukset ∟ Selkärankaisten virukset ∟ RNA-virukset ∟ Retrovirukset RNA-virukset > Virukset > Medical Subject Headings (MeSH) Kasvainvirukset > Selkärankaisten virukset > Virukset > Medical Subject Headings (MeSH) RNA-virukset > Selkärankaisten virukset > Virukset > Medical Subject Headings (MeSH) X
Suppeammat termit:	Alfaretrovirus \| Apinan retrovirukset \| Beetaretrovirus \| Deltaretrovirus \| Endogeeniset retrovirukset \| Epsilonretrovirus \| Gammaretrovirus \| Lentivirus \| Spumavirus X
Annotaatio:	infection = RETROVIRIDAE INFECTIONS; if discussed as tumor viruses, add TUMOR VIRUS INFECTIONS (IM); antiretroviral agents is likely to be ANTI-HIV AGENTS, otherwise index under ANTIVIRAL AGENTS X
historyNote*:	81; was LEUKOVIRUSES 1978-80; was LEUKEMOGENIC VIRUSES 1966-77; RETROVIRUSES, MLV-RELATED was heading 1994-96; ONCOVIRINAE was heading 1992-93, was see RETROVIRIDAE 1991; MURINE LEUKEMIA VIRUS-RELATED RETROVIRUSES & RETROVIRUSES, MURINE LEUKEMIA VIRUS-RELATED were see RETROVIRUSES, MLV-RELATED 1994-96; ONCOVIRUSES was see ONCOVIRINAE 1992-93, was see RETROVIRIDAE 1981-91; RNA TUMOR VIRUSES was see ONCOVIRINAE 1992-3, was see RETROVIRIDAE 1978-91; ONCORNAVIRUSES was see ONCOVIRINAE 1992-93, was see RETROVIRIDAE 1981-91, was see LEUKOVIRUSES 1978-80, & was see ONCOGENIC VIRUSES 1975-77; ONCOVIRUSES, TYPE C was heading 1991-93, was C-TYPE VIRUSES 1974-90 (Prov 1972-73); C-TYPE VIRUSES was see ONCOVIRUSES, TYPE C 1991-93; LEUKOVIRUSES was see ONCOVIRUSES, TYPE C 1991-93, was see ONCOGENIC VIRUSES 1975-77, was heading 1978-90, was see RETROVIRIDAE 1981-90; TYPE C ONCOVIRUSES & TYPE C ONCORNAVIRUSES were see ONCOVIRUSES, TYPE C 1991-93 X
Huomautus:	Family of RNA viruses that infects birds and mammals and encodes the enzyme reverse transcriptase. The family contains seven genera: DELTARETROVIRUS; LENTIVIRUS; RETROVIRUSES TYPE B, MAMMALIAN; ALPHARETROVIRUS; GAMMARETROVIRUS; RETROVIRUSES TYPE D; and SPUMAVIRUS. A key feature of retrovirus biology is the synthesis of a DNA copy of the genome which is integrated into cellular DNA. After integration it is sometimes not expressed but maintained in a latent state (PROVIRUSES). X
onlineNote*:	use RETROVIRIDAE to search RETROVIRUSES, MLV-RELATED; MURINE LEUKEMIA VIRUS-RELATED RETROVIRUSES; & RETROVIRUSES, MURINE LEUKEMIA VIRUS-RELATED 1994-96; ONCOVIRINAE, TYPE C ONCORNAVIRUSES, TYPE C ONCOVIRUSES, & ONCOVIRUSES, TYPE C 1991-93; ONCOVIRUSES 1981-93; LEUKOVIRUSES, ONCORNAVIRUSES, & RNA TUMOR VIRUSES 1978-93; C-TYPE VIRUSES 1972-93 (as Prov 1972-73); use ONCOGENIC VIRUSES to search LEUKOVIRUSES & ONCORNAVIRUSES 1975-77 X
publicMeSHNote*:	81; was LEUKOVIRUSES 1978-80; was LEUKEMOGENIC VIRUSES 1966-77; RETROVIRUSES, MLV-RELATED was heading 1994-96; ONCOVIRINAE was heading 1992-93, was see RETROVIRIDAE 1991; MURINE LEUKEMIA VIRUS-RELATED RETROVIRUSES & RETROVIRUSES, MURINE LEUKEMIA VIRUS-RELATED were see RETROVIRUSES, MLV-RELATED 1994-96; ONCOVIRUSES was see ONCOVIRINAE 1992-93, was see RETROVIRIDAE 1981-91; RNA TUMOR VIRUSES was see ONCOVIRINAE 1992-93, was see RETROVIRIDAE 1978-91; ONCORNAVIRUSES was see ONCOVIRINAE 1992-93, was see RETROVIRIDAE 1981-91, was see LEUKOVIRUSES 1978-80, & was see ONCOGENIC VIRUSES 1975-77; ONCOVIRUSES, TYPE C was heading 1991-93, was C-TYPE VIRUSES 1974-90; C-TYPE VIRUSES was see ONCOVIRUSES, TYPE C 1991-93; LEUKOVIRUSES was see ONCOVIRUSES, TYPE C 1991-93, was see ONCOGENIC VIRUSES 1975-77, was heading 1978-90, was see RETROVIRIDAE 1981-90; TYPE C ONCOVIRUSES & TYPE C ONCORNAVIRUSES were see ONCOVIRUSES, TYPE C 1991-93 X
activeMeSHYear*:	2002 \| 2003 \| 2004 \| 2005 \| 2006 \| 2007X
dateCreated*:	1999-01-01X
dateEstablished*:	1966-01-01X
dateRevised*:	2001-08-07X
recordAuthorizer*:	sjnX
recordMaintainer*:	sjnX
recordOriginator*:	NLMX
Tyyppi:	Käsite X
Vierustermit:	Onkogeeniset DNA-virukset \| Aivotulehdusvirukset \| Arenavirukset \| Astroviridae \| Birnavirukset \| Bromoviridae \| Bunyavirukset \| Deltahepatiittivirus \| Flavivirukset \| Flexiviridae \| Hepevirus \| Kalikivirukset \| Klosterovirukset \| Komovirukset \| Kystovirukset \| Levivirukset \| Luteoviridae \| Mononegavirales \| Mosaiikkivirukset \| Myksovirukset \| Nidovirales \| Nodavirukset \| Pikobirnavirus \| Pikornavirukset \| Potyviridae \| Reovirukset \| Sequiviridae \| Tenuivirus \| Togavirukset \| Tombusvirukset \| Totivirukset \| Tymoviridae X
URI:	X
Nimikkeet ja vastaavat käsitteet:	Retrovirus (fi, korvattu) Retroviridae (sv) Retroviridae (en) RNA Tumor Viruses (en, korvattu) Retroviruses (en, korvattu) Oncoviruses, Type C (en, korvattu) Oncovirinae (en, korvattu) Oncoviruses (en, korvattu) Leukoviruses (en, korvattu) Retroviridae (la-FI, korvattu) X
Jaa:	X